Existem as larvas de mosquito pretas que costumam aparecer nos aquaterrários e lagos, não fazem mal nenhum e serve de alimento, mas normalmente não aparecem nas fezes.
O melhor é realmente consultares um veterinário para que possa ver se realmente são larvitas inofensivas ou algo mais. Tambem podes colocar aqui uma foto desses "vermes" pode ser que alguem até saiba identificar o que são.
(se questionas se pode ser dos gammrus é porque os dás.. e isso é algo que não deve ser dado, não tem beneficios nenhuns para a tartaruga, aconselho-te a não dares, mesmo que seja só como guloseima, há guloseimas que ela vai gostar e fazer bem melhor que isso, como carne por exemplo)