O termostato é um aquecedor mas com controlo de temperatura, ou seja, enquanto que um aquecedor aquece a água "descontroladamente" (o que é terrivelmente desaconselhado para aquários em geral), se tiveres um termostato, é só programares a temperatura que queres e assim que a água atinge essa temperatura ele automaticamente desliga-se, voltando a ligar-se quando a temperatura descer.... desta forma garantes uma temperatura constante no teu aquário.
O termostato é para estar sempre ligado. Programas por exemplo para 25º. Assim que a água chegar aos 25º ele desliga-se, quando começa a descer, ele liga-se outra vez.
Tens é de ter algum cuidado com a escolha da potencia do teu termostato. Normalmente usamos a "regra" 1L para um 1W, ou seja, se o teu aquário tiver por exemplo 50L, deves comprar um termostato com aprox 50W.
Espero ter ajudado.