Eu não sei bem explicar o que acontece, mas basicamente quando tens um espaço com água vai-se criando uma "comunidade" em muitos aquários chegas ao ponto de nem precisar de mudar a água, pois existe um equilibrio enorme no aquário entre fauna e flora. Quando trocas por completo a água estás a "destruir" o pouco equilibrio que o teu espaço de água foi criando. Então troca-se apenas uma parte da água, acho que por poucas palavras se pode dizer que se deve mexer o menos possivel na água.
Mas como eu disse não sei explicar muito bem xD Sei o que é mas colocar por palavras é mais complicado. Mas se procurares nos tópicos sobre tpa,s existem´explicações bem melhores que a minha lol